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张天真教授团队构建四倍体棉花超高密度遗传图谱
发布人: 发布日期: 2015-06-02 浏览次数:
我院棉花研究所在四倍体棉花基因组结构变异研究方面取得重要进展。2015年5月24日，国际权威刊物《骋别苍辞尘别&苍产蝉辫;叠颈辞濒辞驳测,&苍产蝉辫;2015,&苍产蝉辫;16:108》（滨贵=10.5）在线发表了以王森和陈杰丹博士研究生为第一作者的“厂别辩耻别苍肠别-产补蝉别诲&苍产蝉辫;耻濒迟谤补-诲别苍蝉别&苍产蝉辫;驳别苍别迟颈肠&苍产蝉辫;补苍诲&苍产蝉辫;辫丑测蝉颈肠补濒&苍产蝉辫;尘补辫蝉&苍产蝉辫;谤别惫别补濒&苍产蝉辫;蝉迟谤耻肠迟耻谤补濒&苍产蝉辫;惫补谤颈补迟颈辞苍蝉&苍产蝉辫;辞蹿&苍产蝉辫;补濒濒辞辫辞濒测辫濒辞颈诲&苍产蝉辫;肠辞迟迟辞苍&苍产蝉辫;驳别苍辞尘别蝉”论文。这是该所继四倍体棉花基因组测序之后的又一重要进展。
该成果利用二代高通量测序技术和有效的SNP基因型分型方法，构建了四倍体棉花4,999,048SNPs位点的超高密度遗传图谱。该图谱在陆地棉和海岛棉基因组拼接过程中，起到了重要的纠错作用。另外，利用该图谱精细分析了多倍体作物进化过程中的基因组结构变异。通过对二倍体和四倍体棉花基因组结构的比较，发现了亚基因组在进化过程中的结构变异，D亚组的功能着丝粒向A亚组入侵的现象。该项成果也为开发棉花SNP芯片，为棉花分子设计育种提供了很好的应用平台。
&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;本项目得到了国家重点基础研究发展规划（973）项目，国家科技支撑计划，中央高校基础研究基金，江苏高校优势学科建设工程资助项目的支持。
文章链接：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Sequence-based+ultra-dense+genetic+and+physical+maps+reveal+structural+variations
该成果利用二代高通量测序技术和有效的SNP基因型分型方法，构建了四倍体棉花4,999,048SNPs位点的超高密度遗传图谱。该图谱在陆地棉和海岛棉基因组拼接过程中，起到了重要的纠错作用。另外，利用该图谱精细分析了多倍体作物进化过程中的基因组结构变异。通过对二倍体和四倍体棉花基因组结构的比较，发现了亚基因组在进化过程中的结构变异，D亚组的功能着丝粒向A亚组入侵的现象。该项成果也为开发棉花SNP芯片，为棉花分子设计育种提供了很好的应用平台。
&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;本项目得到了国家重点基础研究发展规划（973）项目，国家科技支撑计划，中央高校基础研究基金，江苏高校优势学科建设工程资助项目的支持。
文章链接：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Sequence-based+ultra-dense+genetic+and+physical+maps+reveal+structural+variations
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